More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3828 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 525 aa  1017    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  59.89 
 
 		 523 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  44.85 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  46.65 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  41.81 
 
 		 529 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  42.91 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  46.27 
 
 		 525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  44.77 
 
 		 514 aa  352  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  41.67 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  40.94 
 
 		 528 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  40.83 
 
 		 526 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  41.48 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  40.39 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  43.83 
 
 		 535 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  41.21 
 
 		 511 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  41.9 
 
 		 513 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  40 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  42.34 
 
 		 532 aa  334  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  43.23 
 
 		 522 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  38.82 
 
 		 511 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  44.74 
 
 		 528 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  40.87 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  39.73 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  40.19 
 
 		 513 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  40.39 
 
 		 512 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  39.53 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  39.53 
 
 		 511 aa  323  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  38.75 
 
 		 511 aa  323  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  38.95 
 
 		 520 aa  322  9.000000000000001e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  41.51 
 
 		 495 aa  319  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  39.61 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  39.61 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  40.27 
 
 		 529 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  41.18 
 
 		 512 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  40.16 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 		 518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  49.22 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  39.92 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  39.92 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  41.04 
 
 		 543 aa  313  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  40.39 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  40.39 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  41 
 
 		 522 aa  312  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  40.2 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  40.59 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  39.25 
 
 		 508 aa  310  5e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  40.39 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  39.44 
 
 		 530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  40 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  40.98 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  41.12 
 
 		 521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  38.78 
 
 		 498 aa  302  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  41.31 
 
 		 513 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  40.55 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  39.8 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  39.69 
 
 		 522 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  37.65 
 
 		 511 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  35.05 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  36.71 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  43.37 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  36.82 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  34.86 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  41.2 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  38.84 
 
 		 514 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  43.08 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  40.33 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  42.67 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 		 531 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  40.61 
 
 		 512 aa  289  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  39.81 
 
 		 516 aa  289  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32.57 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  39.62 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  35.74 
 
 		 521 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  39.65 
 
 		 514 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  37.33 
 
 		 533 aa  286  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  40.24 
 
 		 508 aa  286  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  37.9 
 
 		 517 aa  286  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  36.61 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  39.72 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  42.24 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  36.24 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  37.8 
 
 		 521 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>