75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3368 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  327  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  34.27 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  32.19 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  36.5 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  33.09 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  31.47 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  34.85 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  29.29 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.25 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  32.35 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  32.31 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.58 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.41 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  31.2 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  31.2 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.33 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.56 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  34.01 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  29.05 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  28.67 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  34.35 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.95 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  26.95 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  25.52 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.88 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  30.92 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.15 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  27.74 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  28.89 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  26.75 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  29.01 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  31.11 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  26.92 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.6 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.65 
 
 		 451 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1320  hypothetical protein  31.09 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  25.93 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3626  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  25.37 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4174  hypothetical protein  29.66 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.044221  normal  0.709367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  31.5 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  28.38 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  28 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  24.82 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  27.2 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  27.2 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  27.14 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  23.81 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>