More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2149 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  806    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  60.95 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  59.95 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  61.54 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  60.96 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  61.22 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  61.22 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  56.72 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  59.45 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  59.45 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  57.43 
 
 		 401 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  56.47 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  56.22 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  50.23 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  49.63 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  51.24 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  51.99 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  51.99 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  52.99 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.94 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  45.19 
 
 		 409 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  45.19 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  44.94 
 
 		 409 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  38.4 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  42.93 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  37.34 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  42.89 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  41.81 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  41.79 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  41.73 
 
 		 409 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  41.73 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  38.75 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  41.75 
 
 		 409 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  43.18 
 
 		 411 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 		 658 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.45 
 
 		 408 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  40.95 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  42.01 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.41 
 
 		 406 aa  272  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  38.69 
 
 		 647 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  41 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  42.28 
 
 		 671 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  38.13 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  43.85 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  43.03 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.48 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.66 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  38.89 
 
 		 657 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  34.67 
 
 		 715 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  39.41 
 
 		 644 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  35.79 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.32 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  39.12 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.89 
 
 		 661 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.44 
 
 		 412 aa  249  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.16 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  38.96 
 
 		 409 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  39.45 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  37.13 
 
 		 707 aa  247  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  37 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.21 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  38.5 
 
 		 670 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  37.81 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  36.75 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.75 
 
 		 678 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  35.75 
 
 		 678 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  35.75 
 
 		 678 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 649 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  36.5 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37 
 
 		 653 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  41.09 
 
 		 650 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  38.15 
 
 		 650 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  36.59 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  36.59 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.78 
 
 		 647 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  36.79 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  38.65 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  37.25 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  37.25 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.19 
 
 		 418 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.68 
 
 		 647 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.06 
 
 		 651 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  34.92 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  35.66 
 
 		 696 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  36.78 
 
 		 652 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  37.89 
 
 		 676 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.37 
 
 		 657 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  35.16 
 
 		 653 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.48 
 
 		 652 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  36.84 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  38.63 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>