273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2086 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  100 
 
 		 293 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  52.43 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  43.68 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  43.01 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  42.32 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  40.36 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  44.16 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  41.7 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  43.8 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  42.7 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  40.66 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  41.82 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  44.16 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  44.16 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  40.96 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  41.67 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  43.8 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  43.61 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  38.18 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  41.3 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  40.73 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  40.73 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  44.04 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  42.8 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.86 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  42.32 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  38.72 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  41.7 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.45 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  38.46 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  39.78 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  39.6 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  37.2 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  39.6 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  39.44 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  39.02 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  39.64 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  39.43 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  39.05 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  38.93 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.21 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  40.51 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  37.54 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  38.93 
 
 		 317 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  38.13 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  37.96 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  40.36 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  38.68 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  43.43 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  40.36 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  40 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  41.07 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  38.36 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  39.79 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  38.36 
 
 		 315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  40 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  38.38 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  40 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  36.91 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.21 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  39.79 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  38.98 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  38.69 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  36.49 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  38.93 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  39.36 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  38.93 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  38.73 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  36.95 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  37.04 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  37.13 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  38.01 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  39.42 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  39.42 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  39.42 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>