More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1948 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  61.78 
 
 		 554 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  66.91 
 
 		 563 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  65.15 
 
 		 549 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  64.26 
 
 		 558 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  65.81 
 
 		 567 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  65.09 
 
 		 557 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  60.92 
 
 		 560 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  65.07 
 
 		 565 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  65.16 
 
 		 573 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  66.05 
 
 		 564 aa  713    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  63.8 
 
 		 565 aa  681    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  66.18 
 
 		 552 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  65.86 
 
 		 558 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  66.54 
 
 		 552 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  66.11 
 
 		 552 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  67.1 
 
 		 563 aa  705    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  61.05 
 
 		 554 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  69.98 
 
 		 563 aa  774    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  66.98 
 
 		 552 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  65.07 
 
 		 552 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  61.45 
 
 		 556 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  61.79 
 
 		 553 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  66.06 
 
 		 553 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  65.26 
 
 		 567 aa  692    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  61.41 
 
 		 554 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  65.26 
 
 		 567 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  63.41 
 
 		 565 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  61.64 
 
 		 563 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  74.44 
 
 		 541 aa  726    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  66.54 
 
 		 552 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  67.03 
 
 		 552 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  63.78 
 
 		 564 aa  697    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  62.5 
 
 		 574 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  63.45 
 
 		 568 aa  653    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  64.89 
 
 		 552 aa  715    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  67.28 
 
 		 563 aa  708    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  58.5 
 
 		 629 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  64.94 
 
 		 564 aa  703    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  66.36 
 
 		 552 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  66.73 
 
 		 552 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  60.67 
 
 		 563 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  65.68 
 
 		 552 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  64.67 
 
 		 559 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  66.54 
 
 		 552 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  65.49 
 
 		 552 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  64.49 
 
 		 559 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  66.54 
 
 		 552 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  67.59 
 
 		 552 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  63.42 
 
 		 556 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  64.94 
 
 		 560 aa  703    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  100 
 
 		 556 aa  1108    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  69.78 
 
 		 558 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  64.19 
 
 		 557 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  59.59 
 
 		 539 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  59.59 
 
 		 539 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  59.41 
 
 		 539 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  58.86 
 
 		 539 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  58.06 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  59.06 
 
 		 556 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  61.67 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  61.48 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  60.14 
 
 		 554 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  58.87 
 
 		 578 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  58.87 
 
 		 578 aa  618  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6348  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 		 577 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  59.34 
 
 		 562 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  58.83 
 
 		 554 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  58.65 
 
 		 554 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5178  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 577 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  55.76 
 
 		 568 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  54.26 
 
 		 628 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6133  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 552 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376404  normal  0.0270764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  53.28 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6117  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 552 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154468  normal  0.620567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  52.35 
 
 		 553 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3981  major facilitator superfamily MFS_1  50.64 
 
 		 552 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 625 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  54.24 
 
 		 542 aa  535  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  53.72 
 
 		 561 aa  534  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  60.81 
 
 		 632 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  63.86 
 
 		 632 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  61.14 
 
 		 627 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  62.59 
 
 		 630 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3784  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  47.81 
 
 		 539 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  48.01 
 
 		 525 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  46.69 
 
 		 514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1953  general substrate transporter  47.36 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1226  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>