43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0063 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  56.81 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  50.94 
 
 		 214 aa  185  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  38.17 
 
 		 222 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  44.29 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  45 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  46.88 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  40.26 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  40.26 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  40.26 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  37.76 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  35.79 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  35.79 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  35.26 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  35.68 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  40.91 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  38.22 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  45.19 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  46.72 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  38.42 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  46.09 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  45.19 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  37.69 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  41.86 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  37 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  37.25 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  46.21 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  43.57 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  35.78 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  31.87 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  30.63 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  30.63 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  30.15 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  30.68 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  27.98 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.14 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  25.58 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 647 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  26.27 
 
 		 425 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>