40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6560 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  72.15 
 
 		 215 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  77.27 
 
 		 219 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  77.17 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  76.82 
 
 		 218 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  78.64 
 
 		 217 aa  321  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  78.33 
 
 		 217 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  57.44 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  56.92 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  50.71 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  57 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  51.49 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  50.25 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  50.99 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  53.85 
 
 		 250 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  52.82 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  54.73 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  52.82 
 
 		 246 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  48.26 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  51.01 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  49.75 
 
 		 215 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  53.33 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  48.98 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  53.3 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  52.63 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  42.29 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  39.38 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  37 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  43.08 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  41.22 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  30.85 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  32.57 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  36.3 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  36.3 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  32.08 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  27.51 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  46.97 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  29.53 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>