41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1528 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  99.59 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  95.53 
 
 		 250 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  84.26 
 
 		 236 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  76 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  75.63 
 
 		 215 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  55.81 
 
 		 215 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  59.62 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  55.61 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  54.63 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  52.29 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  56.86 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  54.15 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  51.82 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  49.52 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  53.66 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  51.15 
 
 		 220 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  49.52 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  49.05 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  46.7 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  55.88 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  49.53 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  48.39 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  48.61 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  48.31 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  41.05 
 
 		 227 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  40.62 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  39.75 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  32.85 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  35.19 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  39.33 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  30.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  31.62 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  25.35 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 691 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>