48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3377 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  91.16 
 
 		 215 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  77.46 
 
 		 220 aa  328  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  79.13 
 
 		 219 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  73.73 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  72.69 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  74.38 
 
 		 217 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  60.73 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  58.64 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  59.04 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  59.09 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  56.41 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  56.41 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  52.13 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  55.9 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  52.2 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  52.71 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  52.22 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  55.35 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  56.12 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  51 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  50.25 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  49.5 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  48.02 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  44.95 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  54.85 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  39.59 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  46.09 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  44.62 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  34.36 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  40.97 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  38.52 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  37.11 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  33.08 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  32.12 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  31.63 
 
 		 417 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4169  ATPase domain-containing protein  31.63 
 
 		 435 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0180001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2435  histidine kinase  26.62 
 
 		 350 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 507 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 492 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  28.65 
 
 		 1071 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  28.65 
 
 		 1071 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>