43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2530 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  60.19 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  59.22 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  63.35 
 
 		 222 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  56.85 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  59.9 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  57.35 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  57.35 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  55.71 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  57.84 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  51.87 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  53.27 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  49.34 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  53.55 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  56.37 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  56.37 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  50.93 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  52.61 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  50.47 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  53.92 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  52.61 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  52.97 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  49.76 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  47.2 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  51.15 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  53.18 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  41.04 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  47.66 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  37.02 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  43.14 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  39.81 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  42.64 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  34.09 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  39.71 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  39.71 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  34.92 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  34.43 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  34.23 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  31.54 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 793 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.19 
 
 		 686 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 701 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113615 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>