41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4248 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  80.37 
 
 		 217 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  80.28 
 
 		 218 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  74.31 
 
 		 215 aa  330  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  81.37 
 
 		 217 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  327  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  79.13 
 
 		 215 aa  317  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  56.92 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  56.92 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  58.91 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  52.94 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  51.87 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  51.16 
 
 		 209 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  56.44 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  56.12 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  54.59 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  54.59 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  54.08 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  47.49 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  53.89 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  49.02 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  44.76 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  51.43 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  42.08 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  39.7 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  44.7 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  35.14 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  38.57 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  59.42 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  38.81 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  33.95 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  34.51 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  33.55 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  31.42 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  28.47 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 507 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>