41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1741 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  55.45 
 
 
213 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  50.94 
 
 
208 aa  204  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  39.47 
 
 
215 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  35.36 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  42.22 
 
 
222 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  40.97 
 
 
215 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  39.8 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  35.53 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  35.53 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  35.53 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  40.97 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  41.22 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  39.85 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  38.57 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  30.53 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  30.69 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  32.21 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  38.03 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  39.85 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  36.8 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  39.1 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  39.85 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  37.12 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  37.5 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  35.27 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  38.18 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  35.29 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  39.16 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  29.21 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  28.71 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  29.85 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  27.94 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  34.33 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  26.62 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  25.47 
 
 
210 aa  52  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.17 
 
 
180 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  32.89 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>