41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1715 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  95.53 
 
 
246 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  95.12 
 
 
246 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  80.65 
 
 
236 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  77.16 
 
 
215 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  75 
 
 
215 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  54.88 
 
 
215 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  61.06 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  56.48 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  57.07 
 
 
219 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  55.12 
 
 
218 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  52.73 
 
 
220 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  51.83 
 
 
217 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  56.37 
 
 
215 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  49.52 
 
 
209 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  57.84 
 
 
227 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  46.85 
 
 
222 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  49.52 
 
 
209 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  49.05 
 
 
209 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  53.66 
 
 
217 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  50.23 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  48.39 
 
 
216 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  47.47 
 
 
215 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  47.69 
 
 
216 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  41.78 
 
 
212 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  47.62 
 
 
209 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  40.59 
 
 
227 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  38.92 
 
 
213 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  34.26 
 
 
230 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  35.19 
 
 
214 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  36.88 
 
 
198 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  36.88 
 
 
198 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  41.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  35.51 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  31.75 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  36.96 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  32.46 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  30.88 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  24.38 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
691 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>