41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3529 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  79.53 
 
 		 215 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  80.86 
 
 		 216 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  81.4 
 
 		 220 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  59.22 
 
 		 209 aa  251  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  58.74 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  58.25 
 
 		 209 aa  247  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  60 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  47.57 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  48 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  47.26 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  48.98 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  51.53 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  51.38 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  48.98 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  50.83 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  49.53 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  48.74 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  48.86 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  47.95 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  44.76 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  46.15 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  48.02 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  46.86 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  44.5 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  35.65 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  45.19 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  37.28 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  34.33 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  39.85 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  32.89 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  53.03 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  53.12 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  31.06 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  24.12 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  22.5 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  28.88 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>