41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2211 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  72.41 
 
 
209 aa  296  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  71.15 
 
 
209 aa  296  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  70.67 
 
 
209 aa  295  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  60.98 
 
 
215 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  61.58 
 
 
216 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  61.46 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  60 
 
 
216 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  48.08 
 
 
212 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  51.28 
 
 
215 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  50.26 
 
 
215 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  52.91 
 
 
215 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  52.63 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  45.75 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  51.16 
 
 
219 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  52.66 
 
 
218 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  54.85 
 
 
215 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  50.72 
 
 
217 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  50 
 
 
217 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  52.45 
 
 
227 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  46.53 
 
 
246 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  47.18 
 
 
246 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  46.46 
 
 
236 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  48.79 
 
 
222 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  46.73 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  36.63 
 
 
227 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  37.69 
 
 
208 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  35.61 
 
 
230 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  37.09 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  36.63 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  34.3 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  35.27 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  34.3 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  31.66 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  54.41 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  33.82 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.27 
 
 
180 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  23.4 
 
 
210 aa  52  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  29.11 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>