38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1470 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  47.69 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  46.15 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  46.15 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  43.08 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  45.73 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  36.52 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  34.33 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  34.33 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  33.83 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  29.15 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  32.02 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  31.5 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  54.41 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  31.68 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  36.72 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  53.03 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  34.59 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  33.53 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  33.95 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  26.96 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  31.82 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  31.09 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  31.89 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  31.89 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  32.54 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  32.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  31.97 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  32.06 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  27.92 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>