43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3921 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  92.63 
 
 		 217 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  86.79 
 
 		 218 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  81.04 
 
 		 219 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  78.64 
 
 		 220 aa  321  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  73.79 
 
 		 215 aa  318  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  74.76 
 
 		 215 aa  300  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  56.41 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  56.41 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  51.92 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  51.92 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  51.44 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  53.36 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  50.75 
 
 		 220 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  47.47 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  49 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  49.51 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  52.55 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  52.55 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  52.55 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  52.55 
 
 		 236 aa  187  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  51.49 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  51.71 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  50.95 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  37.69 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  37.25 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  42.75 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  33.86 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  32.65 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  37.31 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.69 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  32.89 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  35.07 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  35.07 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  30.35 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  29.2 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  24 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  30.77 
 
 		 417 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4169  ATPase domain-containing protein  30.77 
 
 		 435 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0180001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>