42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1019 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  56.22 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  56.5 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  64.25 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  54.5 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  56.44 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  58.08 
 
 		 236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  54.95 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  55.33 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  56.12 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  53.89 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  51.71 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  45.87 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  53.3 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  48.78 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  49.76 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  51.27 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  52.63 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  50.76 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  50.76 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  50.25 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  48.95 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  46.86 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  50.49 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  44.62 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  49.28 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  38.65 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  38.42 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  36.54 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  36.32 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  42.34 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  40.44 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  40.15 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  34.92 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  39.06 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  39.06 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  30.9 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  32.64 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  24.35 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  29.69 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  25.55 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  20.74 
 
 		 498 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>