37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0520 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  33.83 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  29.9 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  34.21 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  29.27 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  28.78 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  28.86 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  29.5 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  28.88 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  29.02 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  29.44 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  31.09 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  45.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  28.5 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  32.56 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  26.46 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  32.54 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  46.27 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  40.32 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  44.26 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  41.54 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  40.91 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  40.91 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  37.31 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  30.95 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  30.95 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  30.16 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  24.73 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  29.65 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>