43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4839 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  92.99 
 
 
215 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  76 
 
 
246 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  76.65 
 
 
246 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  75 
 
 
250 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  76.26 
 
 
236 aa  292  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  61 
 
 
215 aa  237  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  62.8 
 
 
226 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  57.84 
 
 
220 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  58.82 
 
 
218 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  57.07 
 
 
217 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  61 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  57.84 
 
 
219 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  57.35 
 
 
217 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  51.44 
 
 
222 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  56.02 
 
 
222 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  59.22 
 
 
227 aa  208  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  51.43 
 
 
209 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  51.43 
 
 
209 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  50.95 
 
 
209 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  50.72 
 
 
220 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  48.6 
 
 
215 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  46.98 
 
 
216 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  50.25 
 
 
216 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  52.43 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  43.19 
 
 
212 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  37.37 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  44.52 
 
 
208 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  40.8 
 
 
213 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  35.08 
 
 
214 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  35 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  39.84 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  39.84 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  32.86 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  33.99 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  27.89 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  20.87 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  25.35 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 
666 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 
666 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>