40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3805 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  89.39 
 
 		 198 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  88.89 
 
 		 198 aa  362  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  49.49 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  47.69 
 
 		 204 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  41.41 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  34.84 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  34.33 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  33.9 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  33.9 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  37.18 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  36.54 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  36.96 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  39.37 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  30.69 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  33.97 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  37.21 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  32.42 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  37.69 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  34.18 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  30.92 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  37.88 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  38.52 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  39.1 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  33.94 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  28.74 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  37.04 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  36.3 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  20.2 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  20 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>