83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0194 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  624  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  28.29 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  25.27 
 
 
318 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  24.91 
 
 
318 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  23.51 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 
415 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.71 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.62 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
214 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  19.93 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  26.22 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  19.93 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.69 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  22.16 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.33 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.52 
 
 
267 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  28.77 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  22.29 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.03 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
211 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.97 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  22.42 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.85 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.82 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  20.86 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  21.85 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  23.03 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  25.9 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  34.41 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.31 
 
 
403 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  29.5 
 
 
653 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.95 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.9 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  22.29 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.58 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  23.5 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.26 
 
 
298 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.62 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.49 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6098  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  20.61 
 
 
414 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0238295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  31 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.63 
 
 
424 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
572 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31 
 
 
430 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  25.86 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  32 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.53 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  28.76 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1314 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1340 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  29.9 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
222 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
217 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  20.51 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  24.63 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  28.12 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  20.51 
 
 
400 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  18.99 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.14 
 
 
402 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>