More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0073 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  100 
 
 
370 aa  756  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  62.33 
 
 
370 aa  470  1e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  39.57 
 
 
379 aa  242  8e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  38.21 
 
 
374 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  36.29 
 
 
385 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  35.73 
 
 
384 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  35.73 
 
 
384 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  34.57 
 
 
391 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.57 
 
 
379 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.93 
 
 
380 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.38 
 
 
384 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.31703e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  34.31 
 
 
380 aa  206  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.1 
 
 
384 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  35.01 
 
 
379 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  33.7 
 
 
380 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.73 
 
 
379 aa  203  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.12673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  34.69 
 
 
389 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  36 
 
 
385 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  38.64 
 
 
394 aa  197  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 
379 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  34.32 
 
 
395 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  33.42 
 
 
382 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  35.68 
 
 
383 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  33.8 
 
 
387 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  35.5 
 
 
389 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  34.81 
 
 
397 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  32.72 
 
 
382 aa  191  3e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.85 
 
 
386 aa  190  3e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.96436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.79 
 
 
382 aa  189  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.25 
 
 
382 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  34.26 
 
 
387 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.96 
 
 
387 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  32.34 
 
 
385 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  32.34 
 
 
385 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.41 
 
 
387 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  31.87 
 
 
412 aa  185  1e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.81 
 
 
384 aa  184  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32.9 
 
 
385 aa  183  4e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.94 
 
 
386 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.33 
 
 
385 aa  182  9e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.29 
 
 
400 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  33.88 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  33.88 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  32.7 
 
 
382 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.44 
 
 
382 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  33.96 
 
 
395 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.99 
 
 
382 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.26 
 
 
382 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  32.61 
 
 
375 aa  174  2e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.27 
 
 
384 aa  174  3e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.96245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.59 
 
 
382 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  31.59 
 
 
387 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.19 
 
 
387 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.06 
 
 
383 aa  166  6e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  33.79 
 
 
376 aa  166  6e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.77 
 
 
362 aa  166  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.39 
 
 
362 aa  165  1e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.04 
 
 
362 aa  165  1e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.69 
 
 
381 aa  164  2e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  31.96 
 
 
376 aa  164  2e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  30.71 
 
 
377 aa  163  5e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
380 aa  162  8e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.65 
 
 
383 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  32.53 
 
 
387 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.97 
 
 
382 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  28.77 
 
 
363 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.79 
 
 
381 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  33.15 
 
 
355 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.51 
 
 
383 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  33.87 
 
 
388 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.22298e-05  hitchhiker  1.85369e-06 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  31.44 
 
 
362 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.99 
 
 
384 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.26602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  33.16 
 
 
381 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  34.19 
 
 
360 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  27.7 
 
 
391 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.07 
 
 
360 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  30.73 
 
 
399 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.18 
 
 
391 aa  141  2e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  35.61 
 
 
390 aa  141  2e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  28.81 
 
 
360 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  29.76 
 
 
402 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  31.05 
 
 
360 aa  135  1e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  28.87 
 
 
402 aa  135  1e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  29.23 
 
 
402 aa  135  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  29.49 
 
 
402 aa  134  2e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  30.75 
 
 
357 aa  135  2e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.72 
 
 
417 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  31.14 
 
 
356 aa  134  4e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  30.84 
 
 
356 aa  133  4e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 
406 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  29.53 
 
 
395 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  29.48 
 
 
406 aa  132  7e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.06 
 
 
357 aa  132  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 
406 aa  131  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  27.95 
 
 
396 aa  131  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0713  aminotransferase, class V  29.02 
 
 
397 aa  131  2e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  27.57 
 
 
394 aa  131  2e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  28.46 
 
 
400 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  29.19 
 
 
406 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.31297e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  30.26 
 
 
406 aa  130  5e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>