More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0067 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.01132e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
171 aa  232  2e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.96209e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0200  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
172 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0239  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
172 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0029  translation initiation factor IF-3  63.95 
 
 
173 aa  208  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0217  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
172 aa  208  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  66.46 
 
 
165 aa  205  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  63.37 
 
 
172 aa  200  1e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  3.59846e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1701  translation initiation factor IF-3  63.37 
 
 
172 aa  198  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00889873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0612  translation initiation factor IF-3  56.47 
 
 
173 aa  171  4e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 
219 aa  144  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  42.59 
 
 
179 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 
205 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 
172 aa  140  1e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.34184e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 
190 aa  139  2e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.48528e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  44.65 
 
 
173 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 
186 aa  138  4e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 
195 aa  138  4e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.25648e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.72 
 
 
238 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  43.86 
 
 
172 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 
202 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 
225 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  42.24 
 
 
207 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 
173 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
166 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.60309e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
166 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
166 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.01645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
186 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  6.90292e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
166 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.2216e-07  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
195 aa  134  6e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.20658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
195 aa  134  6e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.45665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
195 aa  134  6e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.32272e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
166 aa  134  6e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.11711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
195 aa  134  6e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.17232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 
175 aa  134  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.87486e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 
177 aa  133  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.06 
 
 
164 aa  133  1e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.14962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  42.36 
 
 
146 aa  133  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88109e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
227 aa  132  2e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  41.18 
 
 
182 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  40.96 
 
 
176 aa  132  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  3.67528e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45.57 
 
 
194 aa  131  4e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
173 aa  131  4e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 
212 aa  131  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 
180 aa  131  5e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
193 aa  131  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.92532e-08  hitchhiker  5.79185e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 
177 aa  131  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
164 aa  130  7e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  39.08 
 
 
178 aa  130  8e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  41.1 
 
 
170 aa  130  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.56408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 
198 aa  129  1e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 
201 aa  129  2e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  41.72 
 
 
243 aa  129  2e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  41.38 
 
 
154 aa  129  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  38.18 
 
 
252 aa  129  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 
253 aa  129  2e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 
192 aa  129  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
174 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 
164 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.72838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 
176 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
170 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  43.27 
 
 
178 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 
198 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 
178 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 
277 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
243 aa  128  4e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
351 aa  128  4e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  39.52 
 
 
357 aa  128  4e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 
196 aa  128  5e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  42.04 
 
 
182 aa  127  5e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  42.33 
 
 
238 aa  128  5e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  42.33 
 
 
238 aa  128  5e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  39.88 
 
 
329 aa  128  5e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  42.33 
 
 
238 aa  128  5e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 
233 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  41.1 
 
 
225 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  40.85 
 
 
194 aa  127  7e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 
221 aa  127  9e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 
171 aa  126  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.44125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  41.98 
 
 
197 aa  126  2e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 
356 aa  125  2e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.87235e-11 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  40.37 
 
 
401 aa  125  2e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  40 
 
 
171 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 
233 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  40.85 
 
 
179 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  42.33 
 
 
396 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 
184 aa  125  4e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  41.21 
 
 
176 aa  124  4e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
190 aa  124  4e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 
182 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
204 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  40.94 
 
 
173 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  39.51 
 
 
173 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 
194 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 
194 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  41.36 
 
 
222 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
250 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  40.27 
 
 
181 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 
164 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.44552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
183 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>