76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2969 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  87.35 
 
 		 324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  77.04 
 
 		 319 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  66.03 
 
 		 322 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  60.07 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  57.88 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  51.83 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  51.7 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  54.46 
 
 		 297 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  50.33 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  44.56 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.46 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  36.07 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.14 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.13 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.59 
 
 		 607 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  31.88 
 
 		 565 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.77 
 
 		 569 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.91 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  25.62 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.2 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.49 
 
 		 526 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.19 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.51 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.3 
 
 		 464 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  34.07 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  34.68 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.78 
 
 		 568 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  31.71 
 
 		 545 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  31.75 
 
 		 601 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.34 
 
 		 567 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.7 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.33 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  32.2 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.89 
 
 		 600 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.97 
 
 		 567 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.89 
 
 		 600 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  36.36 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.37 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  21.95 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.37 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.47 
 
 		 547 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.96 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.11 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  26.32 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.57 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  26.63 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.57 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  28.28 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  31.45 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  26.62 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.66 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  35.48 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.43 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.41 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  23.97 
 
 		 605 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.62 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  28.88 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  32.26 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.78 
 
 		 614 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.07 
 
 		 673 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.74 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.21 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0773  esterase  33.33 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000177288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  24.6 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  27.17 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  29.17 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  42.47 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.87 
 
 		 680 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>