More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2517 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.94 
 
 
550 aa  886    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
553 aa  1061    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  62.85 
 
 
357 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  63.25 
 
 
288 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  66.55 
 
 
326 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  54.96 
 
 
297 aa  289  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.67 
 
 
405 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.67 
 
 
419 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.09 
 
 
403 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.86 
 
 
411 aa  263  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.61 
 
 
448 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.85 
 
 
402 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  55.79 
 
 
410 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.44 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  58.4 
 
 
405 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  62.69 
 
 
414 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.51 
 
 
413 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.82 
 
 
426 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.96 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.26 
 
 
410 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.88 
 
 
407 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.7 
 
 
276 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.04 
 
 
405 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.35 
 
 
426 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.85 
 
 
570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.38 
 
 
385 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.38 
 
 
271 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.15 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  45.52 
 
 
275 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.88 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.58 
 
 
417 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.77 
 
 
304 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.55 
 
 
508 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.34 
 
 
471 aa  210  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.76 
 
 
394 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
475 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  43.46 
 
 
534 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
504 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.62 
 
 
531 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.46 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50.21 
 
 
513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
245 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  42.15 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 
504 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  41.99 
 
 
365 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.26 
 
 
275 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
491 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  55.19 
 
 
490 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
263 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
261 aa  194  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
250 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.83 
 
 
258 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.84 
 
 
250 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  47.86 
 
 
520 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  36.43 
 
 
443 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  39.86 
 
 
368 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.24 
 
 
497 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.12 
 
 
277 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.42 
 
 
258 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
512 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
250 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.98 
 
 
421 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.31 
 
 
275 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
264 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  41.74 
 
 
505 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.42 
 
 
258 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
492 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
254 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  35.12 
 
 
337 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.51 
 
 
258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
266 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.57 
 
 
340 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
513 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  35.21 
 
 
379 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  35.21 
 
 
400 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
272 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  34.78 
 
 
337 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
510 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.75 
 
 
258 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  34.86 
 
 
401 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  38.43 
 
 
359 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
505 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.3 
 
 
422 aa  182  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
259 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  45.08 
 
 
279 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.63 
 
 
344 aa  180  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
502 aa  180  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
283 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>