110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0186 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  100 
 
 		 608 aa  1231    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  80.76 
 
 		 604 aa  986    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  37.24 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  39.05 
 
 		 748 aa  326  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  35 
 
 		 690 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  35.06 
 
 		 550 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  35.96 
 
 		 1016 aa  289  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  34.45 
 
 		 892 aa  284  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  34.74 
 
 		 582 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  34.12 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  34.76 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  33.64 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  34.18 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  33.5 
 
 		 772 aa  250  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.16 
 
 		 765 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  34.01 
 
 		 580 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  31.97 
 
 		 776 aa  227  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  29.79 
 
 		 847 aa  224  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  31.47 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  32.75 
 
 		 1355 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  31.84 
 
 		 652 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  30.24 
 
 		 781 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  26.53 
 
 		 682 aa  161  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  34.88 
 
 		 453 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  30.63 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  33.99 
 
 		 474 aa  140  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  32.69 
 
 		 491 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  30.77 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  30 
 
 		 435 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  29.9 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  34.03 
 
 		 591 aa  133  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  29.87 
 
 		 458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  29.04 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  30.87 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  28.15 
 
 		 456 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  30.1 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  32.18 
 
 		 481 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  25.58 
 
 		 636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  24.27 
 
 		 686 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  24.25 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  27.57 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  34.95 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  31.73 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  26.04 
 
 		 503 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  27.76 
 
 		 565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  34.3 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  30.84 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  27.77 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  24.64 
 
 		 636 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  38.51 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  25.24 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  38.89 
 
 		 600 aa  107  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  25.04 
 
 		 677 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  31.16 
 
 		 253 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  31.36 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  27.8 
 
 		 738 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  30.23 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  32.33 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  23.94 
 
 		 670 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  32.02 
 
 		 675 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  32.02 
 
 		 296 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  25.47 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  29.96 
 
 		 420 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  28.86 
 
 		 420 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  28.86 
 
 		 420 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  29.27 
 
 		 420 aa  97.8  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  28.86 
 
 		 420 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  29.51 
 
 		 450 aa  97.4  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  30.49 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  29.55 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  30.49 
 
 		 420 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  30.49 
 
 		 420 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  30.04 
 
 		 420 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  29.75 
 
 		 279 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  27.68 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  32.42 
 
 		 248 aa  90.9  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  31.14 
 
 		 319 aa  90.9  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  37.86 
 
 		 219 aa  87.4  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  39.66 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  30.56 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  31.34 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  28.69 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  39.66 
 
 		 304 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  30.19 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  27.54 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  32.06 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  29.23 
 
 		 319 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  32.56 
 
 		 314 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  28.23 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  34.09 
 
 		 368 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  28.21 
 
 		 366 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>