More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1047 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  76.55 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  59.5 
 
 		 207 aa  250  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  58.5 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  53.81 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  58 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  56 
 
 		 208 aa  239  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  54.77 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  54.59 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  55 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  55 
 
 		 269 aa  218  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  52.04 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  54.19 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  54.19 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  54.19 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  53.07 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  46.23 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  50.77 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  50.51 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  52.2 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  52.06 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  51.74 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  48.19 
 
 		 202 aa  206  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  50.56 
 
 		 203 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  53.04 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  49.44 
 
 		 202 aa  204  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  50.57 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  45.36 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  44 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  45.35 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  42.29 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.74 
 
 		 290 aa  161  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  39.78 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  26.52 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  24.58 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  22.57 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  25.44 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  25.78 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  25.66 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  25.44 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  25.58 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  24.66 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  23.45 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  23.89 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  23.45 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  24.32 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  40.22 
 
 		 351 aa  62  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  35.14 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  23.01 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  23.89 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  23.89 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  25.32 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  23.89 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  23.45 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.02 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  23.45 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  23.85 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  23.72 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  23.42 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  23.72 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  23.72 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  25.37 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  23.87 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  23.01 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  23.97 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  23.45 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  24.53 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  39.76 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  25.58 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  23.35 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  23.35 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  23.04 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  22.82 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  23.08 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04600  ribosomal protein, putative  26.6 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>