More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2636 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
301 aa  631  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.46 
 
 
301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.46 
 
 
301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.12 
 
 
301 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.46 
 
 
301 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69 
 
 
301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.45 
 
 
301 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.77 
 
 
305 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.78 
 
 
301 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.11 
 
 
302 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.45 
 
 
301 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.2 
 
 
301 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 
305 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.67 
 
 
300 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.75 
 
 
309 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.94 
 
 
290 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.89 
 
 
284 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.24 
 
 
334 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.59 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.29 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.42 
 
 
338 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.96 
 
 
287 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.07 
 
 
286 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
306 aa  260  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.03 
 
 
351 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.66 
 
 
284 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.31 
 
 
284 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.99 
 
 
289 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.28 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  61.27 
 
 
184 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  58.62 
 
 
181 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 
197 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
266 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 
178 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  57.31 
 
 
183 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  54.65 
 
 
208 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 
182 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 
182 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  54.07 
 
 
185 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
184 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  53.22 
 
 
201 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  49.2 
 
 
228 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  48.89 
 
 
190 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
180 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  49.16 
 
 
180 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.98 
 
 
186 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 
179 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  51.09 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  51.09 
 
 
287 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  51.09 
 
 
293 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  51.09 
 
 
299 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  52.02 
 
 
186 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 
178 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 
185 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 
185 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  54.59 
 
 
228 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 
185 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
189 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 
186 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 
186 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 
184 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  51.12 
 
 
182 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  46.56 
 
 
199 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  49.21 
 
 
277 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  53.18 
 
 
177 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.88 
 
 
180 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  49.13 
 
 
180 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 
180 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  51.45 
 
 
186 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 
181 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
186 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 
181 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  53.89 
 
 
175 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 
186 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.55 
 
 
181 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 
186 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 
179 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  48.28 
 
 
180 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
204 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 
180 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 
182 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  45.05 
 
 
186 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  46.35 
 
 
195 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  43.69 
 
 
211 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 
177 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
182 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
191 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  48.86 
 
 
191 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
179 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.28 
 
 
184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.78 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 
178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
182 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.95 
 
 
209 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48 
 
 
176 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  51.45 
 
 
225 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
177 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 
183 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  47.16 
 
 
186 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>