More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1280 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 402 aa  832    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  76.12 
 
 		 402 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.48 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.04 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  30.25 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  30.75 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.67 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  31.94 
 
 		 398 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 779 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  28.91 
 
 		 779 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  28.38 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.99 
 
 		 780 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  28.83 
 
 		 631 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 875 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  25.68 
 
 		 580 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1676 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.31 
 
 		 865 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  27.45 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  27.99 
 
 		 653 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  29.17 
 
 		 704 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  28.4 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 661 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  26.24 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  28.1 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  34.36 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  34.36 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  27.84 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.44 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  38.83 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  35.51 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  35.66 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.31 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  29.14 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  34.78 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.33 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 258 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  34.78 
 
 		 261 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  32.76 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  32.08 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  35.71 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  31.08 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  30.41 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  31.08 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  30.41 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  31.08 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  32.76 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  32.76 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  31.13 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  32.76 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.09 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>