253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9200 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  51.38 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  50.85 
 
 
181 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  48.02 
 
 
180 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.37 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  45 
 
 
178 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.13 
 
 
179 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  43.89 
 
 
178 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  41.44 
 
 
183 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  41.57 
 
 
181 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  37.95 
 
 
198 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.47 
 
 
192 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  36.65 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.76 
 
 
187 aa  128  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
201 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.43 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
221 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
217 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
182 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.66 
 
 
210 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.46 
 
 
203 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  36.9 
 
 
204 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  38.46 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.18 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.85 
 
 
212 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.31 
 
 
215 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.93 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
185 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  50.52 
 
 
98 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.93 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  36.21 
 
 
179 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
199 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.99 
 
 
208 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 
200 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
219 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.84 
 
 
188 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
218 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.24 
 
 
228 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
201 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 
204 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
204 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
181 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
187 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 
199 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
200 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 
178 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  35.16 
 
 
185 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  35.35 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
202 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.62 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.93 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.67 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
208 aa  95.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 
182 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
187 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
190 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 
177 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.32 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  36.99 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
192 aa  87  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.78 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.68 
 
 
176 aa  85.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.17 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.62 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  31.11 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  37.08 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.98 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>