99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5429 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  66.96 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  63.04 
 
 		 230 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  62.45 
 
 		 234 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  64.04 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  54.72 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  47.19 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  38.5 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  32.81 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  35.26 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  25.51 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  31.11 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  35.56 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  35.56 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  31.11 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  35.56 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  36.3 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  33.99 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  34.07 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  34.81 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  34.81 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  34.81 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  34.01 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  28.34 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  32.9 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  31.79 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  32.18 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  31.22 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  27.27 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.43 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  30.15 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  30.22 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  31.89 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  30.94 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  27.27 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  22.03 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  27.51 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  25.26 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  34.17 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  27.42 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  28.29 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  24.87 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  25.57 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  26.04 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.19 
 
 		 808 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.38 
 
 		 807 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.38 
 
 		 807 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  32.58 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.71 
 
 		 803 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  27.56 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1315  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.14 
 
 		 799 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.29 
 
 		 808 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.39 
 
 		 795 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.91 
 
 		 817 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.87 
 
 		 806 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0212  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.01 
 
 		 802 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.69 
 
 		 795 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1761  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 		 805 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.19 
 
 		 795 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0407  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 		 805 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.23 
 
 		 780 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0047  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.65 
 
 		 802 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 		 795 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.96 
 
 		 803 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0162  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.96 
 
 		 824 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.676244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 		 795 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1838  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.06 
 
 		 810 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0684561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3155  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.49 
 
 		 806 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 801 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.58 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.58 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.08 
 
 		 792 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2491  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.39 
 
 		 805 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.68 
 
 		 808 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.79 
 
 		 814 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.78 
 
 		 781 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.7 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.72 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.79 
 
 		 814 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.79 
 
 		 794 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.26 
 
 		 832 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.26 
 
 		 832 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.15 
 
 		 793 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.26 
 
 		 832 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.92 
 
 		 792 aa  42  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1930  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  24.84 
 
 		 804 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0361  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.9 
 
 		 827 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.996315  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1410  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.92 
 
 		 792 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2428  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.18 
 
 		 792 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.153279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.15 
 
 		 792 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.15 
 
 		 792 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0689  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.36 
 
 		 796 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>