More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3366 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  100 
 
 
507 aa  983    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  66.03 
 
 
519 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  63.9 
 
 
517 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  63.81 
 
 
515 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  63.88 
 
 
522 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  56.87 
 
 
518 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  53.68 
 
 
517 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  55.38 
 
 
519 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  52.33 
 
 
519 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  51.95 
 
 
516 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  51.76 
 
 
515 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  49.22 
 
 
518 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  54.53 
 
 
517 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  52.78 
 
 
526 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  45.75 
 
 
538 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  47.49 
 
 
516 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  51.46 
 
 
519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  42.23 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  48.36 
 
 
519 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  48.92 
 
 
517 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  44.1 
 
 
522 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  43.91 
 
 
522 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  43.61 
 
 
999 aa  369  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  50.2 
 
 
521 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  41.55 
 
 
513 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  36.2 
 
 
983 aa  321  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  40.04 
 
 
994 aa  319  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  39.04 
 
 
464 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  31.07 
 
 
463 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  39.68 
 
 
436 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 
639 aa  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  29.75 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  28.63 
 
 
570 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.96 
 
 
668 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  29.81 
 
 
566 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  30.24 
 
 
642 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  29.02 
 
 
556 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  31.34 
 
 
644 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  29.28 
 
 
671 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  29.34 
 
 
643 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  28.36 
 
 
645 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.7 
 
 
658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  30.53 
 
 
572 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.83 
 
 
676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  29.62 
 
 
560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.08 
 
 
692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  31.91 
 
 
667 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.49 
 
 
684 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  29.14 
 
 
583 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.7 
 
 
680 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 
638 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.55 
 
 
680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.43 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  32.21 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.93 
 
 
690 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.14 
 
 
701 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 
682 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.83 
 
 
683 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  28.37 
 
 
708 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  28.36 
 
 
636 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  34.98 
 
 
374 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.39 
 
 
682 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.03 
 
 
765 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  29.05 
 
 
707 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  32.31 
 
 
686 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  29.51 
 
 
715 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.85 
 
 
692 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  30.27 
 
 
676 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  28.23 
 
 
579 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.03 
 
 
687 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
676 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.75 
 
 
712 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.99 
 
 
690 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
684 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.49 
 
 
690 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  29.69 
 
 
559 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  29.57 
 
 
557 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  27 
 
 
641 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.25 
 
 
714 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.59 
 
 
707 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 
564 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  32.34 
 
 
675 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  27.08 
 
 
550 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  32.34 
 
 
675 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 
679 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  28.61 
 
 
715 aa  99.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  29.28 
 
 
550 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.54 
 
 
706 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  27.45 
 
 
681 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.9 
 
 
687 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.94 
 
 
570 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.99 
 
 
701 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.01 
 
 
687 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29 
 
 
690 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  32.06 
 
 
694 aa  94.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0135  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.23 
 
 
699 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  32.46 
 
 
735 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4896  hydantoinase/oxoprolinase  31.51 
 
 
634 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833131  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.29 
 
 
694 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.03 
 
 
683 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>