160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2709 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  100 
 
 		 631 aa  1197    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  39.64 
 
 		 657 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  35.49 
 
 		 647 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36930  predicted membrane protein  34.01 
 
 		 650 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0672336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.75 
 
 		 660 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.9 
 
 		 737 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  40.14 
 
 		 372 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.12 
 
 		 708 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  21.08 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  19 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.01 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  30.65 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  30.65 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  30.65 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  30.65 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  30.65 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  19 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.07 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.5 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.75 
 
 		 691 aa  73.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.1 
 
 		 695 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.1 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  30.1 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  30.1 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.1 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.33 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.38 
 
 		 744 aa  72  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  22.75 
 
 		 721 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00757  hypothetical protein  33.56 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0943161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  30.98 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  30.98 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.99 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  30.98 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.99 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.41 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.99 
 
 		 727 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.47 
 
 		 696 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  30.43 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  26.77 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.26 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  27.51 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.54 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  28.8 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  22.78 
 
 		 711 aa  67.8  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  28.8 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  29.32 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.37 
 
 		 851 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  31.18 
 
 		 732 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.45 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.05 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  31.18 
 
 		 732 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.85 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  22.63 
 
 		 717 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  26.37 
 
 		 883 aa  67  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  21.46 
 
 		 725 aa  67  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.5 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  30.41 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.11 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.5 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  28.81 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  29.24 
 
 		 727 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.88 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  27.36 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.38 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  30.16 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  31.58 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.82 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  32.56 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.82 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.7 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.37 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  30.16 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0570  hypothetical protein  38.3 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.14 
 
 		 763 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  32.28 
 
 		 724 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  32.56 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.33 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.28 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.57 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.63 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  34.07 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.42 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  28.24 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  29.32 
 
 		 364 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  26.7 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  26.7 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  26.7 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>