More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1173 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  65.56 
 
 
579 aa  738  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  65.85 
 
 
595 aa  696  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  66.02 
 
 
583 aa  743  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  62.77 
 
 
575 aa  635  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  66.03 
 
 
593 aa  681  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  68.45 
 
 
569 aa  720  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  60.99 
 
 
582 aa  650  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  76.54 
 
 
577 aa  863  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  74.83 
 
 
605 aa  826  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  67.96 
 
 
574 aa  740  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
578 aa  1154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  60.82 
 
 
572 aa  657  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  66.2 
 
 
568 aa  734  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  62.72 
 
 
579 aa  670  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  66.55 
 
 
574 aa  749  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  70.7 
 
 
573 aa  778  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  64.67 
 
 
600 aa  709  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  82.24 
 
 
567 aa  896  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.34 
 
 
587 aa  652  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  63.12 
 
 
554 aa  645  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  65.63 
 
 
584 aa  709  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  71.14 
 
 
552 aa  748  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  61.19 
 
 
579 aa  667  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  61.17 
 
 
573 aa  638  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  61.26 
 
 
579 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  61.26 
 
 
579 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  61.26 
 
 
579 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  59.54 
 
 
585 aa  612  1e-174  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  61.07 
 
 
576 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 
585 aa  607  1e-172  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 
581 aa  604  1e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  57.8 
 
 
639 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  57.8 
 
 
603 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 
582 aa  577  1e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  55.22 
 
 
582 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 
603 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
585 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
582 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  53.94 
 
 
582 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.77 
 
 
591 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 
567 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.62 
 
 
583 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  46.54 
 
 
562 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 
581 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
583 aa  401  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
546 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.42 
 
 
545 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
539 aa  303  4e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
542 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
557 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 
531 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
516 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  38.58 
 
 
519 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 
552 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
529 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 
543 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.33 
 
 
532 aa  287  3e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
525 aa  286  6e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
534 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
532 aa  285  2e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 
566 aa  285  2e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
543 aa  285  2e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
532 aa  282  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
537 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
528 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
533 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
537 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.72 
 
 
525 aa  280  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 
546 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
519 aa  280  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
547 aa  274  4e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
576 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
559 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
530 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 
560 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
524 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 
556 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.92 
 
 
522 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.22 
 
 
700 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.94 
 
 
602 aa  265  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
559 aa  264  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
564 aa  263  5e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
519 aa  263  5e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
543 aa  263  5e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
508 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 
538 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
567 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.19 
 
 
560 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.05869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
560 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.57 
 
 
560 aa  256  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.59546e-08  hitchhiker  7.4562e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.01 
 
 
560 aa  255  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
536 aa  256  1e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.01 
 
 
560 aa  255  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.88189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.01 
 
 
560 aa  255  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
550 aa  255  2e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
559 aa  255  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.82 
 
 
560 aa  254  4e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.04459e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.39 
 
 
560 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.89 
 
 
560 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.53053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 
520 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>