85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3998 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 326 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  79.75 
 
 		 326 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  43.12 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  30.7 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  25.2 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  27.34 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  26.62 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  26.81 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  26.81 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  26.81 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  26.81 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  26.81 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  44 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  24.89 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  25.69 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  24.89 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  26.81 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  25.9 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  36.25 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  36.25 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  25 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  26.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  46.55 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  44.83 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  44.83 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  44.83 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  38.81 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  27.13 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  32.88 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  24.54 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  23.89 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  34.07 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  40.3 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  31.91 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  41.54 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  27.1 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  30.61 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  38.81 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  40.3 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  38.81 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  27.86 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  35.82 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  25.45 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.81 
 
 		 585 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  41.79 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  41.79 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.81 
 
 		 585 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.81 
 
 		 585 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.75 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  45.83 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  37.31 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  40.3 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  36.36 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  41.67 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  37.31 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  40.3 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  36.92 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  37.31 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  28.03 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  38.81 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  25.9 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  38.81 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  33.73 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  34.33 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  34.33 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  37.31 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>