248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4478 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
602 aa  1202  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  50.76 
 
 
607 aa  561  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  49.39 
 
 
622 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  46.91 
 
 
619 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  49.83 
 
 
611 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  49.75 
 
 
611 aa  517  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  49.28 
 
 
637 aa  517  1e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  50.17 
 
 
602 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  51.06 
 
 
643 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  46.76 
 
 
598 aa  507  1e-142  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  45.9 
 
 
599 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  49.82 
 
 
669 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  49.12 
 
 
673 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  45.7 
 
 
597 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  47.51 
 
 
625 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.30765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.55 
 
 
666 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  48.07 
 
 
599 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  49.06 
 
 
608 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  48.94 
 
 
670 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  49.12 
 
 
670 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  49.06 
 
 
601 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  50.18 
 
 
660 aa  493  1e-138  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  47.46 
 
 
719 aa  492  1e-138  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  50.18 
 
 
660 aa  495  1e-138  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.55921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
660 aa  494  1e-138  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  50.18 
 
 
660 aa  495  1e-138  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.62767e-05  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  48.28 
 
 
616 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12153e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  46.08 
 
 
651 aa  485  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  48.89 
 
 
601 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  48.55 
 
 
601 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  44.44 
 
 
569 aa  467  1e-130  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  48.22 
 
 
702 aa  461  1e-128  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  40.76 
 
 
760 aa  439  1e-122  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  46.51 
 
 
617 aa  439  1e-122  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  44.77 
 
 
611 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 
764 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.1 
 
 
763 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 
616 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 
852 aa  359  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.98 
 
 
604 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  36.91 
 
 
606 aa  313  6e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  33.45 
 
 
596 aa  307  5e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  32.75 
 
 
596 aa  304  3e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.93 
 
 
596 aa  304  3e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.75 
 
 
596 aa  303  5e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.75 
 
 
596 aa  303  5e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.93 
 
 
596 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.75 
 
 
596 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  34.9 
 
 
625 aa  297  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 
623 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.46 
 
 
640 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
628 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
584 aa  273  8e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 
652 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 
652 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  33.72 
 
 
641 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 
640 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  37.42 
 
 
660 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 
607 aa  240  6e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  36.62 
 
 
637 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 
629 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  34.89 
 
 
639 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 
609 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
741 aa  221  2e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
610 aa  218  3e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  27.89 
 
 
595 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  38.48 
 
 
593 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  39.6 
 
 
407 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.25 
 
 
612 aa  197  5e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 
617 aa  191  3e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
617 aa  187  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 
620 aa  181  3e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.26 
 
 
630 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.57 
 
 
628 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.5 
 
 
626 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 
399 aa  142  2e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.97 
 
 
399 aa  138  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  33.62 
 
 
421 aa  135  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 
401 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 
401 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 
414 aa  133  1e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 
402 aa  132  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
414 aa  127  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
414 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 
421 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.92 
 
 
597 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.72 
 
 
596 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 
597 aa  97.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.68 
 
 
597 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.1 
 
 
478 aa  90.1  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 
605 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.72 
 
 
598 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 
486 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.79 
 
 
597 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.62 
 
 
483 aa  86.7  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.51 
 
 
580 aa  86.3  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.79 
 
 
598 aa  85.9  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  28.61 
 
 
597 aa  85.9  2e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 
411 aa  85.5  2e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  26.91 
 
 
499 aa  85.1  3e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>