223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0062 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  952  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  67.8 
 
 
458 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  53.29 
 
 
448 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  51.38 
 
 
448 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  52.65 
 
 
448 aa  493  1e-138  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  31.29 
 
 
445 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  30.02 
 
 
437 aa  200  4e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.15 
 
 
431 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.66 
 
 
455 aa  157  5e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.05 
 
 
452 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.29 
 
 
457 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  31.46 
 
 
781 aa  153  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.71 
 
 
453 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.14 
 
 
451 aa  149  1e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.68 
 
 
468 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  27.65 
 
 
438 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
457 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.05 
 
 
447 aa  142  1e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.23 
 
 
438 aa  140  5e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.23 
 
 
447 aa  139  9e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.18 
 
 
458 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.7 
 
 
454 aa  136  1e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.53 
 
 
458 aa  135  2e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.26 
 
 
502 aa  134  4e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
502 aa  134  4e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.05 
 
 
502 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.82 
 
 
472 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.39 
 
 
473 aa  133  7e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.05 
 
 
500 aa  132  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
456 aa  131  2e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.27 
 
 
500 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.36 
 
 
475 aa  129  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.16 
 
 
465 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
477 aa  126  8e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.97 
 
 
475 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.95 
 
 
504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  27.54 
 
 
445 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.95 
 
 
504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.73 
 
 
456 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  25.2 
 
 
505 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.53 
 
 
499 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.7 
 
 
502 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.76 
 
 
454 aa  123  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
454 aa  122  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
454 aa  121  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.47 
 
 
457 aa  122  2e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.4 
 
 
505 aa  122  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.9 
 
 
476 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.83 
 
 
453 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.02 
 
 
657 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 
456 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  27.36 
 
 
668 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  24.05 
 
 
490 aa  119  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  25.15 
 
 
466 aa  118  2e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.65 
 
 
504 aa  119  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  24.24 
 
 
513 aa  118  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  24.27 
 
 
498 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  24.03 
 
 
507 aa  117  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  24.95 
 
 
466 aa  117  4e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  24.03 
 
 
507 aa  117  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.27 
 
 
449 aa  117  4e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  24.03 
 
 
507 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  24.03 
 
 
507 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  24.03 
 
 
507 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  24.03 
 
 
507 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  24.58 
 
 
454 aa  116  7e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  24.75 
 
 
466 aa  115  1e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  23.83 
 
 
507 aa  115  1e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.95 
 
 
456 aa  116  1e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.19 
 
 
677 aa  115  2e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.51 
 
 
471 aa  115  2e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  25.93 
 
 
469 aa  114  4e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.35 
 
 
441 aa  114  4e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  26.49 
 
 
441 aa  113  8e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.5 
 
 
488 aa  112  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  27.08 
 
 
428 aa  112  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
456 aa  112  2e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.16 
 
 
669 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  25.77 
 
 
438 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.33 
 
 
474 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  25.1 
 
 
471 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.21 
 
 
482 aa  110  8e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  23.87 
 
 
487 aa  109  9e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  25.22 
 
 
468 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  25.88 
 
 
425 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  24.69 
 
 
477 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  25.22 
 
 
468 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.07 
 
 
554 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  24.27 
 
 
486 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  23.88 
 
 
441 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  23.88 
 
 
441 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
472 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.05 
 
 
678 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  24.84 
 
 
467 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  9.46369e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  24.84 
 
 
467 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.05 
 
 
678 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  24.84 
 
 
467 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  27.83 
 
 
685 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  23.68 
 
 
506 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  23.68 
 
 
506 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>