120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6178 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 691 aa  1371    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  45.88 
 
 		 651 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  42.15 
 
 		 678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  46.63 
 
 		 679 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  45.84 
 
 		 681 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.57 
 
 		 664 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.41 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  42.41 
 
 		 692 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  40.37 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.56 
 
 		 675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  42.23 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  37.65 
 
 		 718 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  41.43 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  36.85 
 
 		 718 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  41.43 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  41.43 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  39.97 
 
 		 687 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  40.96 
 
 		 719 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  40.41 
 
 		 672 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  41.13 
 
 		 671 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  39.05 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  42.16 
 
 		 722 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  39.13 
 
 		 736 aa  351  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  39.87 
 
 		 676 aa  349  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  37.04 
 
 		 697 aa  334  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.25 
 
 		 631 aa  333  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.87 
 
 		 739 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  37.55 
 
 		 708 aa  310  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.48 
 
 		 687 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  34.02 
 
 		 642 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  33.28 
 
 		 752 aa  290  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  35.33 
 
 		 646 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  34.89 
 
 		 711 aa  278  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.7 
 
 		 683 aa  277  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  33.12 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  33.12 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  32.55 
 
 		 637 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  43.87 
 
 		 661 aa  271  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  38.07 
 
 		 671 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.16 
 
 		 632 aa  253  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  39.04 
 
 		 310 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  41.95 
 
 		 322 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.99 
 
 		 319 aa  197  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  43.17 
 
 		 319 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.32 
 
 		 651 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  41.92 
 
 		 322 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  41.05 
 
 		 328 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.59 
 
 		 654 aa  189  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.75 
 
 		 613 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.13 
 
 		 653 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.98 
 
 		 387 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 331 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  30.77 
 
 		 331 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  30.42 
 
 		 331 aa  125  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.8 
 
 		 307 aa  120  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  29.04 
 
 		 327 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  30.04 
 
 		 308 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  32.22 
 
 		 354 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.47 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.09 
 
 		 326 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  28.63 
 
 		 274 aa  94  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  27.82 
 
 		 265 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  36.49 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  25.36 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  29.61 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.81 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.67 
 
 		 343 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.43 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.05 
 
 		 270 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.85 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.08 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.87 
 
 		 578 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.6 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.32 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  28.15 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.13 
 
 		 291 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.26 
 
 		 307 aa  62  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  27.13 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  29.18 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  24.33 
 
 		 265 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  25.56 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  35.22 
 
 		 339 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  29.95 
 
 		 294 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  29.5 
 
 		 318 aa  53.9  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  26.1 
 
 		 273 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  36.11 
 
 		 277 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  23.98 
 
 		 328 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.69 
 
 		 309 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  27.06 
 
 		 296 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  28.82 
 
 		 317 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.67 
 
 		 283 aa  50.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  26.73 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  32.73 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.29 
 
 		 565 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>