38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6485 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  100 
 
 		 494 aa  1029    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  31.45 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  26.81 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 		 1242 aa  83.6  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  26.54 
 
 		 820 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.83 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.51 
 
 		 1628 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.03 
 
 		 1332 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  25 
 
 		 789 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  23.85 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.29 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  25.76 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  23.16 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  26.64 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.64 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  32.77 
 
 		 1202 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  25.32 
 
 		 307 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  25.2 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  31.39 
 
 		 812 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25.91 
 
 		 272 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  20.14 
 
 		 870 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  33 
 
 		 814 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  26.8 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  31.03 
 
 		 303 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  30.39 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  33.77 
 
 		 1236 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  23.05 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  36.56 
 
 		 640 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  28.97 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  38.18 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  29.67 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  24.07 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  23.4 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  25.93 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  27.45 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  43.9 
 
 		 354 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  44.9 
 
 		 725 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>