74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6064 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  100 
 
 		 453 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  30.05 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  31.57 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  29.26 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  32.17 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  30.28 
 
 		 502 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  31.31 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  30.8 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  29.12 
 
 		 552 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.21 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  30.54 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  30.54 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  30.3 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.97 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  29.41 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  29.3 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.82 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  26.76 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  30.31 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  27.44 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.71 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.67 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  28.67 
 
 		 578 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  29.84 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27.7 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  31.51 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  30.84 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  29.43 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  29 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  28.06 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3750  Curlin associated repeat protein  35.63 
 
 		 585 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  34.48 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  31.11 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  35.54 
 
 		 178 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  29.15 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  46.15 
 
 		 139 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  27.78 
 
 		 139 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  41.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  25.13 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  40 
 
 		 151 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  38.75 
 
 		 157 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  39.8 
 
 		 139 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  39.8 
 
 		 139 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  32.43 
 
 		 139 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  34.29 
 
 		 139 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  32.81 
 
 		 160 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  43.08 
 
 		 139 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  41.18 
 
 		 154 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  38.75 
 
 		 157 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  34.88 
 
 		 144 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  37.5 
 
 		 142 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  38.75 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  38.75 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  38.75 
 
 		 151 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  38.75 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  40 
 
 		 151 aa  47.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  34.11 
 
 		 160 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  34.11 
 
 		 160 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  43.08 
 
 		 139 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  34.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  34.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  39.53 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  34.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  34.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0926  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0402571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  34.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  27.1 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  30.41 
 
 		 143 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  32.8 
 
 		 180 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  29.13 
 
 		 144 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  28.14 
 
 		 245 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  36.29 
 
 		 139 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>