273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5500 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  44.73 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 
227 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  36.8 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  39.11 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
254 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  32.14 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  31.11 
 
 
224 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  32.44 
 
 
224 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 
224 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 
243 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
227 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  34 
 
 
237 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  30.74 
 
 
238 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  30.74 
 
 
238 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
236 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  28.89 
 
 
224 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  29.78 
 
 
246 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  32.99 
 
 
234 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  31.68 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
235 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  29.82 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
237 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  30.65 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  31.5 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
237 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  31.5 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
237 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
237 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
214 aa  85.5  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  33.17 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  32.54 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  33.01 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  28.7 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  31.35 
 
 
269 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  29.33 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  34.81 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  35.36 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  30.85 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  34.81 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  30.64 
 
 
236 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  25.21 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  28.43 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  31.49 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  29.18 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  26.73 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.19 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  23.64 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.12 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  26.48 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  26.85 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  26.11 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  26.85 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  26.85 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  25.62 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  26.27 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  26.73 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.68 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  25 
 
 
248 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 
257 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.27 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  28.34 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.61 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  24.11 
 
 
250 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.64 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  26.27 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  28.76 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  23.77 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.27 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  25.65 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  30.68 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  24.58 
 
 
229 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>