118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3493 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  100 
 
 
433 aa  888    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  52.29 
 
 
464 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  41.81 
 
 
449 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  39.47 
 
 
430 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  40.57 
 
 
449 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  33.26 
 
 
382 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  33.09 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  30.36 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  29.54 
 
 
373 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.17 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  34.87 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  31.16 
 
 
543 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  33.16 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  32.29 
 
 
551 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.24 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  30.1 
 
 
600 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.43 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  30.1 
 
 
600 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.25 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.42 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  27.78 
 
 
542 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  28.79 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.79 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  29.29 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 
567 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  34.73 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  29.25 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25.95 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  27.11 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.1 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  26.67 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.12 
 
 
571 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.51 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.77 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.8 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.77 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  29.11 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  29.02 
 
 
547 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.41 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.8 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.09 
 
 
567 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.02 
 
 
318 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.02 
 
 
318 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.05 
 
 
568 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  30.46 
 
 
533 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  25.6 
 
 
570 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.11 
 
 
569 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.1 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.66 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.18 
 
 
572 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.57 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  26.19 
 
 
373 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.18 
 
 
572 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.52 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.97 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  25.06 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.93 
 
 
601 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  25.7 
 
 
468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.39 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  28.22 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.46 
 
 
300 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  24.71 
 
 
319 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.6 
 
 
352 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  29.14 
 
 
346 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  31.82 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  32.58 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  25.23 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25.23 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  28.49 
 
 
320 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.03 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.7 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  24.77 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  24.77 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  28.2 
 
 
342 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  23.96 
 
 
468 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  30.51 
 
 
302 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  24.37 
 
 
334 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.47 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  27.51 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.81 
 
 
369 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  30 
 
 
389 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  28.7 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  21.72 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.29 
 
 
443 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  22.52 
 
 
365 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.93 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  23.1 
 
 
713 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.62 
 
 
376 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  22.22 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.97 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.79 
 
 
327 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.03 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.02 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  26.5 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  27.75 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  22.22 
 
 
319 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  27.55 
 
 
369 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>