208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0908 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  74.45 
 
 
774 aa  1196  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  90.6 
 
 
765 aa  1400  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.00172e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  90.6 
 
 
765 aa  1403  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.1692e-05  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  71.61 
 
 
766 aa  1160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  98.82 
 
 
765 aa  1571  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.691e-06  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
765 aa  1582  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  6.25202e-05  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  71.48 
 
 
774 aa  1141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.34249e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  90.08 
 
 
765 aa  1395  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.15644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  94.38 
 
 
765 aa  1463  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  67.28 
 
 
764 aa  1088  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  89.95 
 
 
765 aa  1393  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.08036e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
765 aa  1582  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  87.99 
 
 
765 aa  1391  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  69.4 
 
 
766 aa  1087  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.79496e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  72.09 
 
 
773 aa  1135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.70887e-05  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  73.01 
 
 
773 aa  1166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  39.07 
 
 
771 aa  540  1e-152  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  37.34 
 
 
735 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.12563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  35.81 
 
 
750 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  36.68 
 
 
790 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  36.77 
 
 
784 aa  460  1e-128  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  34.81 
 
 
787 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.5541e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  34.46 
 
 
786 aa  453  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  34.46 
 
 
786 aa  452  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  34.63 
 
 
784 aa  454  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  34.46 
 
 
786 aa  453  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.14767e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  34.68 
 
 
785 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.24307e-06  hitchhiker  5.64634e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  34.46 
 
 
786 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.5449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.00577e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.76585e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.67581e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  33.92 
 
 
781 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  35.2 
 
 
781 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.25468e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 
784 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  34.47 
 
 
773 aa  447  1e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  32.95 
 
 
780 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.45954e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  34.57 
 
 
781 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  33.6 
 
 
750 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  33.6 
 
 
750 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.3296e-06  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  34.17 
 
 
807 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  32.7 
 
 
801 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  33.04 
 
 
799 aa  432  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  34.44 
 
 
781 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  33.46 
 
 
799 aa  425  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  33.29 
 
 
787 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.18031e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  30.89 
 
 
926 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  31.95 
 
 
935 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  31.3 
 
 
932 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  30.66 
 
 
905 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  31.17 
 
 
937 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 
934 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.82 
 
 
919 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.58 
 
 
924 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.34 
 
 
922 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.18 
 
 
938 aa  358  3e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  30.56 
 
 
738 aa  347  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.41 
 
 
753 aa  344  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 
757 aa  322  2e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
836 aa  311  3e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  28.75 
 
 
792 aa  309  1e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 
792 aa  309  2e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 
813 aa  308  4e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 
810 aa  303  6e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  28.7 
 
 
860 aa  302  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  30.84 
 
 
849 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  29.84 
 
 
813 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  29.42 
 
 
813 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 
794 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.19 
 
 
751 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  29.16 
 
 
1091 aa  291  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  29 
 
 
811 aa  291  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 
826 aa  290  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  28.46 
 
 
821 aa  289  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.69 
 
 
789 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.45 
 
 
839 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  27.87 
 
 
786 aa  286  1e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 
791 aa  286  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 
824 aa  286  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  27.87 
 
 
786 aa  286  1e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  27.87 
 
 
786 aa  286  1e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.76 
 
 
787 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
761 aa  285  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 
786 aa  285  2e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.4 
 
 
839 aa  285  3e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.42 
 
 
728 aa  285  3e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 
786 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.2 
 
 
787 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 
788 aa  280  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 
786 aa  280  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 
786 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 
794 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 
783 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>