66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3273 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  89.24 
 
 		 344 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  97.97 
 
 		 345 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  97.68 
 
 		 345 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  722    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  89.53 
 
 		 344 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  89.28 
 
 		 345 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  89.24 
 
 		 344 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  89.24 
 
 		 344 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  92.46 
 
 		 345 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  73.26 
 
 		 345 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  60.42 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  41.89 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  38.7 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  39.55 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  38.08 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  38.08 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  36.75 
 
 		 514 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  37.76 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  37.28 
 
 		 523 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  36.64 
 
 		 530 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  35.69 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  37.71 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  29.18 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  35.34 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  32.48 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  34.98 
 
 		 393 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  29.36 
 
 		 427 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  34.05 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  29.05 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  33.46 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30.4 
 
 		 721 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.68 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  30.77 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.15 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  28.15 
 
 		 474 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  28.89 
 
 		 595 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  32.18 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  33.97 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  32.75 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  33.55 
 
 		 777 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  33.64 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  32.44 
 
 		 566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 		 456 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.06 
 
 		 831 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  29.18 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  32.62 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 632 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  31.02 
 
 		 520 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  32.41 
 
 		 503 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  30.99 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  29.52 
 
 		 498 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  24.24 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  24.01 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  24.42 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.45 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  27.8 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25.62 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  32 
 
 		 726 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  28.91 
 
 		 615 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.06 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  33.7 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  27.03 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  29.11 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  27.11 
 
 		 698 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.01 
 
 		 1892 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  27.59 
 
 		 494 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>