208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1774 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  97.63 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  98.1 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  92.89 
 
 		 210 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  76.81 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  72.33 
 
 		 220 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  71.08 
 
 		 208 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  70.87 
 
 		 208 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  69.9 
 
 		 209 aa  314  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  72.33 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  92.55 
 
 		 161 aa  277  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  74.63 
 
 		 209 aa  273  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  30.15 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  30.5 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 416 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.93 
 
 		 419 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  31.03 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  30.15 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.76 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25.38 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  29.56 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  26.29 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  28.27 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  26.37 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  27.37 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  27.17 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  25 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  27 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.36 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  25.76 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  25.73 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  26.34 
 
 		 423 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  27.67 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  27 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  25.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  25.71 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  25.13 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  25.14 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  25.14 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  26.16 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  26.16 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  26.18 
 
 		 422 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  26.16 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  22.79 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  26.24 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  24.71 
 
 		 417 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  26.47 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  25.43 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  25.43 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  25.43 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  25.43 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  25.43 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  25.73 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  25.38 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  25.38 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  24.75 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  24.66 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.58 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  26.44 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  25.38 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  26.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  24.28 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  27.14 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  22.33 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  22.33 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  25.93 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  25.95 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  23.9 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  28.02 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>