55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3611 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 396 aa  806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  71.79 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  69.77 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  69.77 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  69.77 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  69.02 
 
 		 397 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  69.77 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  69.27 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  68.77 
 
 		 395 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  69.02 
 
 		 395 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  69.52 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  67.34 
 
 		 396 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  67.34 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  65.84 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  62.97 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  62.5 
 
 		 400 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  39.8 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  35.5 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  36.82 
 
 		 450 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  33.75 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  32.92 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  32 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  29.15 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  28.95 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  27.48 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  31.14 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  28.5 
 
 		 425 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  28.26 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  26.81 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  28.96 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  28.96 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  29.82 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  23.97 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  23.69 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  23.69 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  23.84 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  25.3 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.75 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  23.01 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  24.47 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  22.73 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  27.19 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  22.47 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  22.47 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  22.47 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  22.47 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  33.12 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0149  Type II secretory pathway component PulL-like protein  26.3 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  23.08 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  23.46 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  24.31 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  28.87 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  24.05 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  37.25 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>