292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  44.07 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.19 
 
 
238 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  36 
 
 
231 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  36.64 
 
 
251 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  35.09 
 
 
233 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  39.53 
 
 
230 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  35.22 
 
 
238 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  39.3 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  34.1 
 
 
237 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  36.02 
 
 
250 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  36.32 
 
 
241 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  34 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  37.5 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  40.7 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.16 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.71 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  31.93 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  36.79 
 
 
240 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.78 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  31.33 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  37.26 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.04 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  33.04 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  34.4 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  34.09 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  35.54 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.57 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.6 
 
 
267 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  31.52 
 
 
312 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  34.77 
 
 
274 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  31.67 
 
 
253 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  40.19 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  37.04 
 
 
250 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  31.97 
 
 
245 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  32.78 
 
 
245 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.19 
 
 
273 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.91 
 
 
235 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  34.26 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  33.73 
 
 
255 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  33.33 
 
 
255 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  36.91 
 
 
236 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  36.91 
 
 
236 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  36.91 
 
 
236 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  38.76 
 
 
254 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  37.67 
 
 
253 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  37.67 
 
 
253 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  36.44 
 
 
253 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.16 
 
 
245 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  39.17 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  32.88 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.04 
 
 
602 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  35.44 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  36.53 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  32.11 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  36.84 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  37.67 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  36.77 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  39.68 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  37.39 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  36.57 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  32.94 
 
 
278 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  34.91 
 
 
268 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  32.94 
 
 
278 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  36.36 
 
 
254 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  36.36 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  35.54 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  37.19 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  37.19 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  37.19 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  36.49 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  34.88 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  39.09 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1237  peptidase C26  37.5 
 
 
238 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  35.47 
 
 
254 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.36 
 
 
233 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  34.48 
 
 
268 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  37.27 
 
 
251 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  35.64 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  36.68 
 
 
279 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  33.06 
 
 
272 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  33.48 
 
 
238 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  33.77 
 
 
299 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  35.86 
 
 
238 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  34.4 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  31.62 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  36.32 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  40.18 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  40.18 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  36.65 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  39.73 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  33.04 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  35.32 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>