41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  44.96 
 
 		 225 aa  101  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  35.53 
 
 		 233 aa  94  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  36.64 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  38.16 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  32.75 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 210 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  34.94 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  32.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  32.97 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  34.07 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  27.91 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  31.11 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  29.11 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  28 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.1 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  24.36 
 
 		 264 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  34.57 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  32.1 
 
 		 184 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  29.89 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  24.68 
 
 		 267 aa  41.6  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  26.97 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.66 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  25.58 
 
 		 338 aa  41.2  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  29.87 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  27.22 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>