96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00780  transposase  100 
 
 
402 aa  806    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  92.79 
 
 
402 aa  724    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
348 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
370 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.92 
 
 
348 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
348 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
348 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
348 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
348 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.72 
 
 
359 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.72 
 
 
359 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.01 
 
 
327 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.94 
 
 
354 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.46 
 
 
363 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  35.25 
 
 
378 aa  176  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  37.71 
 
 
356 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.57 
 
 
422 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11250  hypothetical protein  94.87 
 
 
91 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.01 
 
 
364 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.01 
 
 
364 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.71 
 
 
147 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  53.51 
 
 
141 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.38 
 
 
297 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.47 
 
 
350 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.5 
 
 
354 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.59 
 
 
352 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
387 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.97 
 
 
175 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  33.11 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  33.11 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  21.41 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  47.76 
 
 
72 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  60.53 
 
 
172 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  20.26 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1284  hypothetical protein  23.42 
 
 
333 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.159965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  31.1 
 
 
408 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.67 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  31.1 
 
 
408 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.74 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.26 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  23.57 
 
 
418 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  23.68 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  20.26 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  23.68 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3996  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.14 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.729024  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.77 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.77 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  19.49 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0247  transposase  27.87 
 
 
473 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  33.9 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  33.9 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  33.9 
 
 
398 aa  46.6  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.77 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.28 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  32.48 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.98 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.37 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.37 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.37 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  33.9 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.21 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.01 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  29.07 
 
 
154 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  29.07 
 
 
154 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.92 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>